TG组织细胞术能够在二维水平上对数据样本进行深度的定量分析。由于这种定量技术的适用范围广泛，不仅拥有众多动物体研究案例，在植物研究方面，同样也可以获得很好的定量分析数据。
下面我们就从植物学研究方向入手，对植物切片样本的结构进行识别，并通过多个参数进行定量分析。这种定量研究的意义，除了给研究者们提供更客观准确的数字化定量数据，以满足科研文章严谨翔实的本质需求外，还可以建立一套标准化的、获得国际认可的植物学领域定量分析方法，为解决植物学研究的难点提供技术手段。
落叶松次生维管组织的定量分析
如果能通过染色把形成层和其它细胞层区分离出来，再分别进行计数，结果更准确，或者是手动圈出形成层区域（上图为手动圈出一个范围）范围内细胞数目：111。
形成层列数计数时，可以沿一层细胞进行划线，识别线经过的细胞数，即为列数：7。
但是针对上图圈中区域一列细胞消失的情况，如需计算消失后列数，可同样在内侧画线，进行列数识别。
（以上图片来源：中国林业科学研究院林业研究所，林木遗传育种国家重点实验室 李万峰老师Tree Genetics & Genomes (2017) 13:19 DOI 10.1007/s11295-017-1106-3）
植物花粉颗粒结构分析
原始影像
特定微小结构
花粉囊（小孢子囊）识别
花粉管识别
花粉萌发研究
原始影像
花粉管识别
植物导管定量分析
原始影像
定量根横截面的总面积
形态学定量的韧皮部导管